Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms