Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms