Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah1bQ06985 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms