Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms