Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox10Q04888 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox10Q04888 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms