Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn6Q03958 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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