Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms