Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms