Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms