Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms