Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms