Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx2P97474 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms