Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ptprn2P80560 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms