Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx2P80206 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms