Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NficP70255 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms