Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl39P62892 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms