Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d2P62838 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms