Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms