Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ctdsp1P58466 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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