Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms