Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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