Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp25P57080 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp25P57080 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms