Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcanP55066 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcanP55066 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcanP55066 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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