Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms