Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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TspoP50637 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms