Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpbP50405 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpbP50405 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpbP50405 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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