Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcl5P50228 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cxcl5P50228 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cxcl5P50228 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cxcl5P50228 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cxcl5P50228 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cxcl5P50228 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms