Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LmnaP48678 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LmnaP48678 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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