Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VdrP48281 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VdrP48281 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VdrP48281 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VdrP48281 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VdrP48281 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VdrP48281 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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