Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrprbP47758 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrprbP47758 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms