Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms