Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms