Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms