Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms