Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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