Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cap1P40124 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms