Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms