Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms