Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms