Protein–RNA interactions for Protein: P28662

Bri3, Brain protein I3, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bri3P28662 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bri3P28662 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms