Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms