Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo2P25801 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms