Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms