Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms