Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZfaP23607 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZfaP23607 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZfaP23607 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms