Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms