Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms