Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms