Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpcP21841 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms