Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fcer1aP20489 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fcer1aP20489 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcer1aP20489 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Fcer1aP20489 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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